Professeur d'EPS, ancien entraîneur de l'équipe Festina, de Christophe Bassons et de Jérôme Chiotti, il dirige aujourd'hui AlternatiV, une cellule de recherche, d'entraînement et de communication.
1996 à 1998 : Entraîne l'équipe Festina, en particulier pour les contre-la-montre.
1998 : Crée AlternatiV, une cellule d'entraînement, de recherche et de communication, visant à proposer une alternative au dopage, fondée sur des méthodes d'entraînement transparentes, scientifiques et interactives.
2010 : entraîne Matt Decanio, un ancien professionnel américain, dopé repenti, désormais établi en France et évoluant dans la formation Olympique cycliste Val d'Oise. Il chronique le Tour de France pour Le Monde.
Ils ont dit de lui
2002
Richard Virenque (ancien coureur Festina entraîné par A. Vayer) : "Je me suis aperçu très vite qu'il n'était pas compétent et je ne lui ai pas accordé ma confiance." (Plus fort qu'avant - Jean-Paul Vespini - Robert Laffont 2002)
2007
Jean-Marie Leblanc (ancien Directeur du Tour de France) : "Ce chercheur autoproclamé qui calcule la puissance développée par les coureur devant son écran de télévision ?" (Le Tour de ma vie - Jean-Marie Leblanc - Solar 2007)
2009
Laurent Fignon, visiblement ignorant de la méthode de calcul des watts : "Je ne crois pas du tout les études scientifiques faites à la télévision, en regardant la télé, en décomptant le nombre de coups de pédales, le soi-disant braquet qu'ils ne connaissent pas non plus, de toute façon. Donc tout ça, c'est du pipeau. C'est pour faire vendre du papier. C'est toujours les mêmes que l'on voit faire ça, tous les ans. Ce sont des gens qui, grâce au dopage, gagnent de l'argent, se font une réputation là-dessus de blancheur. On prend le cas d'Antoine Vayer, je vous rappellerais quand même qu'il était dans l'affaire 98 avec Festina. Donc je ne vois pas comment on peut prendre ses propos au sérieux."
Europe 1 - 23/07/2009
Il a dit
"Le sport c'est atteindre ses limites, le dopage les dépasser."
"Il est clair qu'un certain nombre de coureurs qui sont toujours devant depuis le début de saison n'ont plus de limites musculaires. C'est comme un moteur qui tourne à 12000 tours sans s'encrasser. Ils peuvent rouler des heures comme ça sans fatigue. Plus ils roulent, plus ils récupèrent, c'est dégueulasse pour les autres." (Libération - 17-18/04/1999)
"Des Bassons purs et durs mentalement, il y en a peut-être trois ou quatre dans le peloton." (L'Equipe 05/07/1999)
A propos de la puissance développée par Lance Armstrong dans le Tour de France 1999 : "Humainement et physiologiquement, ce n'est pas possible." (Le Monde 30/10/1999)
A propos de Lance Armstrong : "Armstrong je ne le considère pas, pas plus qu'Indurain. Ils ne sont rien, ne valent rien. Ceux qui ont gagné le Tour pour moi s'appellent Michele Ferrari et Sabino Padilla (NDLR : professeur de physiologie et préparateur auprès de Miguel Indurain chez Banesto). Ce sont eux les champions." (La Flamme Rouge - 12/2005)
A propos de Fabian Cancellara : "Quand j’entraînais l’équipe Festina à la fin des années 90, les coureurs étaient «boostés» à mort à l’EPO, anabolisants et autres hormones de croissance. Leurs performances n’arrivaient pas à la cheville de ce que réalise Cancellara. C’est tout simplement impossible humainement et sans aide extérieure." (swissinfo.ch - 03/07/2010)
"La lutte antidopage sert de paravent à la tricherie. Tout le monde sait bien qu’il est très facile de contourner les dispositifs de contrôle. Le coureur sait exactement quel test il va subir et à quel moment. Il va pouvoir adapter sa posologie en conséquence, ce sera d’autant plus facile s’il a beaucoup d’argent." (swissinfo.ch - 03/07/2010)
Ses propositions pour lutter contre le dopage
"Certes, l'espoir de trouver les modifications de l'expression de certains gènes est mince. Reste le contrôle longitudinal très rapproché : c'est-à-dire prises de sang et d'urine, fiche anthropométrique pour mesurer les os (pour détecter la prise d'hormone de croissance), le tout géré par un organisme indépendant."(Libération - 28/07/2006)